Откако американскиот научник Ерик С. Ландер формално го предложи полиморфизмот на единечен нуклеотид (SNP) како трета генерација на молекуларен маркер во 1996 година, SNP беше широко користен во анализата на асоцијацијата на економските особини, изградбата на карти на биолошка генетска поврзаност и скрининг на човечки патогени гени., Дијагноза и предвидување на ризикот од болести, индивидуализиран скрининг на лекови и други области на биолошки и медицински истражувања.Во областа на одгледување на готовински култури, откривањето на SNP може да реализира ран избор на потребните особини.Овој избор има карактеристики на висока точност и може ефикасно да го избегне мешањето на морфолошките и факторите на животната средина, а со тоа во голема мера го скратува процесот на размножување.Затоа, СНП игра огромна улога во полето на основните истражувања.

Полиморфизам со единечен нуклеотиден (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) се однесува на феноменот дека постојат единечни нуклеотидни разлики во иста позиција во секвенцата на ДНК на индивидуи од ист или различен вид.Вметнувањето, бришењето, конверзијата и инверзијата на една основа може да ја предизвикаат оваа разлика.Во минатото, дефиницијата за СНП беше различна од онаа за мутација.Варијантен локус бара фреквенцијата на еден од алелите во популацијата да биде поголема од 1% за да се дефинира како локус SNP.Меѓутоа, со проширувањето на современите биолошки теории и примената на технологијата, алелната фреквенција повеќе не е неопходен услов за ограничување на дефиницијата на SNP.Според податоците за единечни нуклеотидни варијации вклучени во базата на податоци за единечни нуклеотидни полиморфизми (dbSNP) под Националниот центар за биотехнолошки информации (NCBI), се вклучени и вметнување/бришење со ниска фреквенција, варијации на микросателити итн.

Во човечкото тело, фреквенцијата на SNP е 0,1%.Со други зборови, во просек има една локација SNP на 1000 базни парови.Иако фреквенцијата на појавување е релативно висока, не сите SNP локации можат да бидат кандидатски маркери поврзани со особини.Ова е главно поврзано со локацијата каде што се појавува СНП.

Теоретски, SNP може да се појави каде било во геномската секвенца.SNP кои се појавуваат во кодираниот регион може да произведат синонимни мутации и несинонимни мутации, односно, аминокиселината се менува или не се менува пред и по мутацијата.Променетата аминокиселина обично предизвикува пептидниот синџир да ја изгуби својата првобитна функција (missense мутација), а исто така може да предизвика прекин на преводот (бесмислена мутација).SNP кои се појавуваат во некодирачки региони и меѓугенски региони може да влијаат на спојувањето на mRNA, составот на некодирачката секвенца на РНК и врз ефикасноста на транскрипционите фактори и ДНК.Специфичната врска е прикажана на сликата:

Видови SNP:

Неколку вообичаени методи за пишување SNP и нивна споредба

Според различни принципи, вообичаените методи за откривање SNP се поделени во следниве категории:

Споредба на класификација на методите за откривање

Забелешка: Наведени во табелата во моментов се користат повообичаени методи за откривање на SNP, други методи за откривање како што се хибридизација на специфична локација (ASH), продолжување на прајмер за специфична локација (ASPE), продолжување на една база (SBCE), сечење на специфично место (ASC), технологија за генски чипови, технологија за масена спектрометрија итн. не се класифицирани и споредени.

Трошоците и времето на прочистување на нуклеинската киселина во горенаведените неколку вообичаени методи за откривање на SNP се неизбежни.Сепак, поврзаните комплети базирани на директната PCR технологија на Foregene можат директно да вршат PCR или qPCR засилување на непрочистени примероци, што носи невидена погодност за откривање на SNP.

Производите од директната серија на PCR на Foregene едноставно и грубо ги испуштаат чекорите за прочистување на примерокот, што во голема мера го намалува времето и трошоците потребни за подготовка на шаблони.Уникатната Taq полимераза има одлична способност за засилување и може да толерира различни инхибитори од сложени опкружувања за засилување.Овие карактеристики обезбедуваат техничка гаранција за добивање специфични производи со висок принос. Комплетовите Foregene Direct PCR/qPCR за различни типови примероци, како што се: животински ткива (опашка стаорец, зебра риба, итн.), лисја од растенија, семиња (вклучувајќи полисахариди и полифенолни примероци) итн.